оптичний мікроскоп дозволяє спостерігати тільки великі органели: пластиди і ядро клітини. Електронна ж мікроскопія дає можливість вивчати зовсім малі органели: мітохондрії, рибосоми, а також окремі структури цитоплазми (ендоплазматичну мережу, апарат Гольджі).